白果树的生长过程中，多种病虫害对白果树的生长结果都有一定的危害，较轻时可以不进行防治，为害严重时应及时进行防治。
为害白果树的病虫害主要有，茎腐病，黑斑病，炭疽病，轮纹病，叶斑病，苗木猝倒病，早期黄化病，干枯病，根腐病，果实腐烂病，大袋蛾，黄刺蛾，山楂叶螨等。
对于这些病虫害的防治，仅靠单一的药物防治，不能达到理想的效果，应在预防为主，综合防治的方针指导下，采取农业防治和化学防治等综合治理措施，才能达到控制和根治的目的。
1，选好圃地
栽培白果苗木的地块应选择地势较平坦，土层深厚，疏松，肥力较好，排水方便的，不要在土层薄，黏性强，积水涝洼地育苗。
2，精细整地
土壤要深翻，可减少病虫害，同时土壤增施充分腐熟的有机肥，做好土壤的消毒工作。
3，种子消毒
白果播种育苗用的种子，要进行湿沙催芽，因此得对沙子和种子进行必要的消毒处理，以防种子和沙子带病菌。常用的方法就是，在白果种子贮藏前，用高锰酸钾溶液进行种子消毒处理，用甲基托布津进行沙子的消毒。
4，适时早播与遮荫
播种育苗时要适时早播，覆土厚度要适中，可促进幼苗的早发而健壮，提高其抗病虫能力。
白果是一种喜光植物，但苗期需要进行遮荫，应于播种后及时搭建遮荫棚，遮荫率不要超果60%，低不低于40%。每天上午9点遮，下午4点后揭开。也可与其他作物或幼龄果树进行间作套种，既能有效地减轻或避免日灼，控制病虫害的发生。
5，加强肥水管理
白果树栽培时要施足基肥，6月份后要增施钾肥。干旱时及时浇水，降低地温，松土除草，培养壮苗，提高抗病能力。
6，修剪控制
白果树的病枝，病苗，落叶都潜藏着很多病菌及害虫，特别是越冬时期，应结合修剪加以清理，并及时烧掉或深埋，可极大程度的减少病虫害的发生，是一项很好的措。对于树皮下潜藏的越冬害虫，可进行树干涂白来进行防治枝干病虫害。
7，药物防治
白果树在阴雨天气下易发病，应及时喷药防治，以控制病虫害的蔓延。常用的药物有，甲基托布津，多菌灵，代森锰锌，甲维盐，阿维菌素，浏阳霉素等，从5月下旬至7月上旬交替使用，每7天左右喷施一次，7月上旬可间隔进行喷施一次1%的硫酸亚铁，一般喷3–4次，可取得良好的效果。
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